La finalitat del programa MUS-E és fomentar les arts, especialment la música, el cant, el teatre, la dansa i les arts plàstiques dins l'àmbit escolar, per afavorir la integració social educativa i cultural dels nens i nenes, prevé la violència, el racisme i fomenta la tolerància i la unió entre diferents cultures, des del respecte a la diversitat.
El MUS-E fa èmfasi en la importància del diàleg i la interacció entre les diferents cultures, així com en el desenvolupament de la creativitat i la imaginació en la pràctica de les disciplines artístiques com a base de l'educació.
